Phénobois

Phénobois

Nom de la plateforme
Plateforme Phénobois
Localisations
Site d’Orléans: 2163, avenue de la pomme de pin - CS 40001 Ardon - 45075 ORLEANS
Site de Bordeaux-Cestas: 69, route d'Arcachon - 33610 CESTAS
Site de Bordeaux-Pessac: Université Bordeaux 1, Bâtiment B2 - RdC Est - Allée Geoffroy St-Hilaire - CS 50023 - 33615 PESSAC
Site de Clermont-Crouël: 5, chemin de Beaulieu - 63000 CLERMONT-FERRAND
Site Web
https://phenobois.hub.inrae.fr/
Phenobois_localisation_mission
Description

Phénobois est une plateforme spécialisée dans l’analyse des propriétés physico-chimiques du bois et hydrauliques des arbres. Créée en 2008, elle comprend du personnel hautement qualifié et des équipements technologiques de pointe distribués au sein de trois unités de recherche : BioForA (Centre Val de Loire, site d’Orléans), BIOGECO (Centre Nouvelle-Aquitaine-Bordeaux, sites de Cestas et Pessac) et PIAF (Centre Auvergne-Rhône-Alpes, site de Crouël).

Les outils de phénotypage développés par Phénobois permettent de (1) caractériser le bois et comprendre les processus d’élaboration de ce tissu, (2) étudier l’adaptation et la réponse des arbres au stress hydrique, (3) identifier les ressources génétiques forestières capables de s’adapter aux climats changeants de demain tout en produisant du bois de qualité et en quantité.

Phénobois met en œuvre une approche multi-échelle allant de la cellule jusqu’à la caractérisation du bois des arbres issus de populations naturelles ou des programmes d’amélioration génétique. Selon les technologies mises en œuvre, la plateforme atteint des capacités d’analyses à haut débit, soit plusieurs milliers d’échantillons par an.

Phénobois répond aux besoins de la communauté scientifique académique nationale, internationale et des acteurs industriels pour progresser dans l’analyse des grandes problématiques d’avenir concernant la forêt et la sylviculture.

 

Ainsi, Phénobois :

- Accompagne ses utilisateurs dans la construction de leurs projets de recherche en évaluant les moyens humains, financiers et techniques nécessaires

- Réalise des développements méthodologiques innovants et assure une veille technologique active pour maintenir un niveau technique d’excellence,

- Met à disposition ses ressources matérielles pour une utilisation autonome, auprès d’utilisateurs qu’elle a préalablement habilités à cette utilisation

- Accompagne ses utilisateurs dans la valorisation des données

 

Forte de ces missions, Phénobois est labellisée “Infrastructure Scientifique Collective INRAE ” depuis 2018, "Plateforme de l'Université de Bordeaux" depuis 2019.

Phénobois a également obtenu sa certification ISO 9001 : 2015 le 9 janvier 2023 intitulée « Mise en œuvre et développement d’appréciations directes ou indirectes de paramètres phénotypiques en lien avec les propriétés structurales, physiques et chimiques du bois ». Le périmètre de certification couvre les activités de préparation d’échantillons, broyage, chimie du bois, spectrométrie infrarouge et microtomographie des sites d’Orléans, Bordeaux-Cestas et Clermont-Crouël.

Services

Phenobois propose une diversité de mesures d’appréciation directe ou indirecte de paramètres phénotypiques en lien avec les propriétés physico-chimiques du bois et hydrauliques des arbres.

PrestationsSite réalisant le travail
Préparation d’échantillons - broyage - tamisage – distribution de biomasse 
Broyage au broyeur à bille Restch MM400Orléans
Broyage avec le broyeur ultracentrifuge Restch ZM200Orléans
Broyage au broyeur à couteaux Restch SM2000Orléans
Broyage avec l'agitateur SK550Orléans/
Bordeaux Cestas
Distribution robotisée de biomasse en plaque 96 puitsOrléans
TamisageOrléans
Préparation d’échantillons -lyophilisation - séchage 
LyophilisationOrléans
Séchage en étuveOrléans
Analyses chimiques 
Extraction des composés phénoliquesOrléans
Dosage des composés phénoliques totaux au réactif FOLINOrléans
Dosage des composés phénoliques par HPLC/DADOrléans
Extractions des sucres solublesOrléans
Dosage des sucres par HPLC/DEDLOrléans
Dosage de l'amidon au réactif GOPODOrléans
Extraction et dosage des lipides totaux (réactif vanilline)Orléans
Détermination du potentiel de saccharification
(dosage du glucose issu de la cellulose au réactif GOPOD)
Orléans
Dosage des extractibles par gravimétrie
(obtention du résidu pariétal)
Orléans
Dosage des lignines Klason par gravimétrieOrléans
Dosage des hémicelluloses et cellulose
(quantification par HPLC des sucres en C5 et C6 libérés après hydrolyse acide)
Orléans
Détermination des cendres par gravimétrie après chauffage à 550°COrléans
Spectrométrie infra-rouge 
Acquisition des spectres spectromètre
PerkinElmer Frontier ou Bruker-MPA
Orléans/
Bordeaux Cestas
Location SPIR portable journéeOrléans
Location SPIR portable semaineOrléans
Expertise scientifique : Définition du besoin et conception
de l'échantillonnage, spectromètres labo et portables
Orléans/
Bordeaux Cestas
Expertise scientifique : Analyse des spectres et création
de modèle de calibration, spectromètres labo et portables
Orléans/
Bordeaux Cestas
Expertise scientifique : Analyse des spectres et
utilisation de modèle de calibration, spectromètres labo et portables
Orléans/
Bordeaux Cestas
Microdensitométrie 
Découpe de barreaux à la scie à rubanBordeaux Cestas
Découpe des planchettes à la scie à lames jumellesBordeaux Cestas
Dérésinage (traitement au pentane)Bordeaux Cestas
Radiographie aux rayons X et développement film radioBordeaux Cestas
Analyse microdensitométrique sous Windendro avec scanBordeaux Cestas
Expertise scientifique : Analyses des donnéesOrléans
Mesure des propriétés physiques et mécaniques du bois 
Mesure de l'infradensité du boisOrléans
Mesure de la couleur (modèle CIELab),
spectrocolorimètre Konica-Minolta
Orléans
Mesure des propriétés hydrauliques des arbres et des plantes 
Espèces vulnérables :  pour 100 Vulnerability Curve (VC),
CAVI STANDARD
Bordeaux Pessac/Clermont
Espèces résistantes :  pour 60 VC, CAVI STANDARDBordeaux Pessac/Clermont
Espèces vulnérables, vigne : pour 50 VC, CAVI 1000Bordeaux Pessac
Espèces vulnérables, tropicales : pour 25 VC, CAVI 1000Bordeaux Pessac
Espèces résistantes, chêne vert : pour 25 VC, CAVI 1000Bordeaux Pessac
Herbacées : pour 20VC, CAVI SMALL & MEDIUMBordeaux Pessac/Clermont
Espèces vulnérables pour 5 VC, EMBOLIVEBordeaux Pessac
Espèces résistantes pour 5 VC, EMBOLIVEBordeaux Pessac
Traitement d'images pour 5 VC, EMBOLIVEBordeaux Pessac
Microscopie Phenom pro Desktop SEM &
Métalliseur Cressington 108 Auto (accès au matériel par 1/2 journée)
Bordeaux Pessac
Micromotomographie à Rayon X 
Micromotomographie à Rayon X (accès au matériel par 1/2 journée)Clermont
Personnel
Phenobois_organigramme
Modalités d'accès

La plateforme Phénobois souhaite amener son expertise au plus tôt dans l'élaboration des projets de recherche auxquels elle participe. Aussi nous vous encourageons à nous contacter dès le montage de votre projet, pour que nous puissions nous impliquer dans votre réponse aux différents appels d'offres.

Tout contact doit se faire par courriel : contact-phenobois@inrae.fr. Vous serez alors orienté vers votre correspondant Phénobois avec lequel vous pourrez échanger, présenter votre projet scientifique et formuler vos attentes vis-à-vis de la plateforme. Vous recevrez un avis quant à la faisabilité de votre projet selon les modalités de sélection décrites dans la charte d’accès à la plateforme, ainsi qu’une estimation du coût et des délais de réalisation. Le démarrage du projet est conditionné par votre acceptation formelle du devis en envoyant le document validé au correspondant Phénobois.

Pour tout projet recevable, Phénobois s'engage à mettre à disposition du personnel formé et compétent, proposer des équipements performants et entretenus, apporter une assistance technique voire une expertise scientifique, réaliser les analyses ou former les utilisateurs à leur réalisation, informer de l'état d'avancement du projet et accompagner les utilisateurs dans la valorisation de leurs données.

Unité d'accès et coût

Les tarifs proposés par Phénobois dépendent des analyses, des expertises mises en œuvre et de l’organisme d’affiliation du demandeur.

Nous identifions 4 niveaux :

- Tarif INRAE : appliqué à toutes les autres unités de l’Institut

- Tarif interne : appliqué aux utilisateurs des unités d'adossement BIOFORA, BIOGECO et PIAF

- Tarif organismes publics : appliqué à l’ensemble des partenaires publics ou assimilés (Universités, ONF, CNRS,   IRD,  CIRAD, …) français, européens et internationaux.

- Tarif secteur privé : applicable aux utilisateurs des entreprises de statut privé françaises et internationales.

 

 

Phénobois applique les règles de prévision de recettes internes (payé sur crédit INRAE) et externes (payé hors crédits INRAE) de l’Institut, avec le calendrier budgétaire associé. Dans ce cadre, aucune analyse ne pourra être facturée entre octobre et décembre de l’année en cours si le projet n’a pas été prévu avant fin août. Les bons de commandes devront, dans ce cas, être envoyés avant la fin octobre de l’année afin que la facturation soit validée pour l’année budgétaire en cours. La seule exception à ce cycle budgétaire s’applique aux unités INRAE ayant affiché la plateforme comme partenaire lors de l’établissement du contrat de recherche.

Équipements

PhenoBois met au service de la communauté scientifique un parc d’équipements de pointe diversifié ainsi que des équipements prototypes innovants parfois uniques (Cavi1000 par exemple). Le tableau suivant présente les principaux instruments mis à disposition pour les expérimentations.

Phenobois_equipement